MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017819	TGA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859011
2	NC_017819	T	7	7	29	35	0 %	100 %	0 %	0 %	386859011
3	NC_017819	ATT	2	6	41	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859011
4	NC_017819	TTA	2	6	54	59	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859011
5	NC_017819	A	6	6	447	452	100 %	0 %	0 %	0 %	386859012
6	NC_017819	TTTA	2	8	453	460	25 %	75 %	0 %	0 %	386859012
7	NC_017819	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859012
8	NC_017819	TAT	2	6	498	503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
9	NC_017819	TAT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
10	NC_017819	TC	3	6	537	542	0 %	50 %	0 %	50 %	386859012
11	NC_017819	TAA	2	6	543	548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859012
12	NC_017819	TTA	2	6	556	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
13	NC_017819	TTTC	2	8	569	576	0 %	75 %	0 %	25 %	386859012
14	NC_017819	TAGAT	2	10	579	588	40 %	40 %	20 %	0 %	386859012
15	NC_017819	TTTC	2	8	604	611	0 %	75 %	0 %	25 %	386859012
16	NC_017819	T	6	6	640	645	0 %	100 %	0 %	0 %	386859012
17	NC_017819	TAT	2	6	701	706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
18	NC_017819	T	6	6	785	790	0 %	100 %	0 %	0 %	386859012
19	NC_017819	AAATA	2	10	825	834	80 %	20 %	0 %	0 %	386859012
20	NC_017819	CTG	2	6	842	847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859012
21	NC_017819	ATT	2	6	915	920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859012
22	NC_017819	ATCA	2	8	935	942	50 %	25 %	0 %	25 %	386859013
23	NC_017819	TAA	2	6	1015	1020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859013
24	NC_017819	T	8	8	1040	1047	0 %	100 %	0 %	0 %	386859013
25	NC_017819	T	6	6	1069	1074	0 %	100 %	0 %	0 %	386859013
26	NC_017819	CTC	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859013
27	NC_017819	CTT	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859013
28	NC_017819	ATA	2	6	1306	1311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859013
29	NC_017819	TTA	2	6	1313	1318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
30	NC_017819	TTTC	2	8	1326	1333	0 %	75 %	0 %	25 %	386859013
31	NC_017819	ATT	2	6	1378	1383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
32	NC_017819	TAT	2	6	1404	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859013
33	NC_017819	A	6	6	1571	1576	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
34	NC_017819	TTA	2	6	1577	1582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
35	NC_017819	TC	3	6	1598	1603	0 %	50 %	0 %	50 %	386859014
36	NC_017819	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859014
37	NC_017819	A	6	6	1623	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
38	NC_017819	GCTA	2	8	1636	1643	25 %	25 %	25 %	25 %	386859014
39	NC_017819	TCT	2	6	1658	1663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859014
40	NC_017819	ATA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
41	NC_017819	A	6	6	1682	1687	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
42	NC_017819	TTTC	2	8	1689	1696	0 %	75 %	0 %	25 %	386859014
43	NC_017819	TTA	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
44	NC_017819	TAT	3	9	1728	1736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
45	NC_017819	TAG	2	6	1746	1751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859014
46	NC_017819	A	7	7	1789	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	386859014
47	NC_017819	TAA	2	6	1796	1801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
48	NC_017819	ACT	3	9	1858	1866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859014
49	NC_017819	TAA	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859014
50	NC_017819	TAATA	2	10	1912	1921	60 %	40 %	0 %	0 %	386859014
51	NC_017819	TCTAT	2	10	1979	1988	20 %	60 %	0 %	20 %	386859014
52	NC_017819	CAT	2	6	1989	1994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859014
53	NC_017819	ATT	2	6	2074	2079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859014
54	NC_017819	T	6	6	2078	2083	0 %	100 %	0 %	0 %	386859014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.